Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms