Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO4P61968 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO4P61968 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO4P61968 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMO4P61968 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms