Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFM1P61960 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFM1P61960 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms