Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ROMO1P60602 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms