Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms