Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFDNP55196 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFDNP55196 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFDNP55196 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFDNP55196 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFDNP55196 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms