Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB3P54284 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms