Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNQ1P51787 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNQ1P51787 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms