Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms