Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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