Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX2P50458 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX2P50458 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX2P50458 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms