Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
UTRNP46939 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTRNP46939 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
UTRNP46939 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTRNP46939 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms