Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP5P45974 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP5P45974 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP5P45974 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP5P45974 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP5P45974 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP5P45974 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP5P45974 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms