Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms