Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MDH1P40925 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms