Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCAP37840 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCAP37840 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms