Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms