Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP214P35658 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP214P35658 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP214P35658 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP214P35658 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP214P35658 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms