Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms