Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms