Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms