Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFKBIAP25963 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms