Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms