Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPREP23469 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms