Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms