Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms