Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNNT1P13805 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms