Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2AP11388 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2AP11388 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms