Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms