Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLK3P07288 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLK3P07288 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLK3P07288 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms