Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTMAP06454 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTMAP06454 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTMAP06454 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTMAP06454 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTMAP06454 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTMAP06454 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTMAP06454 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTMAP06454 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTMAP06454 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTMAP06454 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTMAP06454 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTMAP06454 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTMAP06454 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTMAP06454 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTMAP06454 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms