Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCCAP05165 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCCAP05165 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCCAP05165 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms