Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYBBP04839 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYBBP04839 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYBBP04839 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms