Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C6orf47O95873 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms