Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms