Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDNEP1O95476 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDNEP1O95476 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms