Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSO75390 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSO75390 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSO75390 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSO75390 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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