Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA3O75145 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms