Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms