Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC9O60706 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC9O60706 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ABCC9O60706 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ABCC9O60706 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms