Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms