Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms