Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLX3O43711 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLX3O43711 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TLX3O43711 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TLX3O43711 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TLX3O43711 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TLX3O43711 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TLX3O43711 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TLX3O43711 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLX3O43711 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms