Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPATO15228 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPATO15228 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPATO15228 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPATO15228 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms