Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms