Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APAF1O14727 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APAF1O14727 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APAF1O14727 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APAF1O14727 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms