Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms