Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms