Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN34H7C241 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms