Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF26H0Y7S4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms